Hola mvallari,
Puede haber varias razones por las que tu gatita quiere marcar su territorio y está haciendo afuera del arenero, como estrés o cambios hormonales. Si no está esterilizada, puede ser que haya entrado en celo, y esto cambia mucho la conducta de las hembras.
Si es estrés, es posible que vaya despareciendo por sí solo conforme se acostumbre por completo al espacio. En todo caso, asegúrate de que la caja de arena está en un lugar tranquilo, donde la gata se sienta segura y de que la arena está limpia, para ayudar a que haga donde le corresponde.
¡Mucha suerte!